Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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PTPRNQ16849 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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