Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDKN3Q16667 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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