Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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SSX1Q16384 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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SSX1Q16384 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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SSX1Q16384 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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SSX1Q16384 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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SSX1Q16384 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SSX1Q16384 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SSX1Q16384 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SSX1Q16384 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SSX1Q16384 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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SSX1Q16384 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SSX1Q16384 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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