Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
USF2Q15853 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
USF2Q15853 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
USF2Q15853 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
USF2Q15853 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
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