Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NCOA1Q15788 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms