Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHBQ15464 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHBQ15464 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHBQ15464 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SHBQ15464 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SHBQ15464 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SHBQ15464 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHBQ15464 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHBQ15464 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHBQ15464 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHBQ15464 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHBQ15464 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHBQ15464 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHBQ15464 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHBQ15464 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHBQ15464 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHBQ15464 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHBQ15464 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHBQ15464 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHBQ15464 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHBQ15464 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHBQ15464 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SHBQ15464 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHBQ15464 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHBQ15464 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHBQ15464 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHBQ15464 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SHBQ15464 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHBQ15464 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SHBQ15464 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHBQ15464 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHBQ15464 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHBQ15464 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SHBQ15464 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SHBQ15464 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHBQ15464 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHBQ15464 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHBQ15464 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SHBQ15464 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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