Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKX1-1Q15270 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKX1-1Q15270 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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