Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPAQ15257 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms