Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKD1Q15139 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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