Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ODF1Q14990 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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