Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NFIXQ14938 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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