Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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PDE6HQ13956 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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PDE6HQ13956 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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PDE6HQ13956 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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PDE6HQ13956 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6HQ13956 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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