Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAPSQ13938 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CAPSQ13938 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
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