Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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ITGA9Q13797 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ITGA9Q13797 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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