Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
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SHROOM2Q13796 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
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SHROOM2Q13796 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
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SHROOM2Q13796 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
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SHROOM2Q13796 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
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SHROOM2Q13796 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SHROOM2Q13796 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
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SHROOM2Q13796 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
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SHROOM2Q13796 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
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SHROOM2Q13796 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
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SHROOM2Q13796 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
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SHROOM2Q13796 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHROOM2Q13796 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
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