Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PMS2P11Q13670 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms