Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CUL4BQ13620 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
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