Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MTMR3Q13615 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
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