Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEUROD1Q13562 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEUROD1Q13562 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
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