Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BFSP2Q13515 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BFSP2Q13515 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms