Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CHAF1BQ13112 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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