Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKRN3Q13064 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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