Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSTF3Q12996 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CSTF3Q12996 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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