Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4Q12950 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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