Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOBRQ0VD83 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms