Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASGEF1BQ0VAM2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms