Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RBBP4Q09028 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms