Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms