Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
LRP1Q07954 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LRP1Q07954 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms