Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIN1Q05586 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms