Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PTPN12Q05209 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPN12Q05209 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms