Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EMX1Q04741 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EMX1Q04741 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms