Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CYP4A11Q02928 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CYP4A11Q02928 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms