Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PLCB3Q01970 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PLCB3Q01970 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms