Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ARF6P62330 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
ARF6P62330 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
ARF6P62330 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ARF6P62330 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ARF6P62330 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARF6P62330 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARF6P62330 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARF6P62330 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARF6P62330 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARF6P62330 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARF6P62330 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARF6P62330 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARF6P62330 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARF6P62330 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARF6P62330 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARF6P62330 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARF6P62330 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARF6P62330 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARF6P62330 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARF6P62330 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ARF6P62330 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms