Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLTPP55058 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PLTPP55058 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PLTPP55058 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLTPP55058 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms