Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CRISP1P54107 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms