Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
COPAP53621 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
COPAP53621 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
COPAP53621 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
COPAP53621 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.2 ms