Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA3P52797 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms