Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRIM1P49642 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms