Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTGIRP43119 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGIRP43119 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms