Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRPPRCP42704 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRPPRCP42704 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms