Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLR2IP36954 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLR2IP36954 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms