Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJA4P35212 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJA4P35212 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJA4P35212 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJA4P35212 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJA4P35212 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJA4P35212 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJA4P35212 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA4P35212 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA4P35212 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA4P35212 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA4P35212 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA4P35212 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA4P35212 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA4P35212 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA4P35212 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA4P35212 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA4P35212 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA4P35212 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA4P35212 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA4P35212 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA4P35212 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA4P35212 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA4P35212 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA4P35212 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA4P35212 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA4P35212 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA4P35212 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJA4P35212 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJA4P35212 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJA4P35212 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms