Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXA9P31269 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms