Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CRABP1P29762 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms