Protein–RNA interactions for Protein: P21695

GPD1, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD1P21695 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GPD1P21695 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GPD1P21695 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GPD1P21695 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GPD1P21695 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms