Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF3P18847 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF3P18847 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF3P18847 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF3P18847 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF3P18847 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF3P18847 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF3P18847 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF3P18847 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF3P18847 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATF3P18847 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF3P18847 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF3P18847 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF3P18847 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF3P18847 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF3P18847 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF3P18847 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF3P18847 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF3P18847 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF3P18847 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF3P18847 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF3P18847 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF3P18847 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF3P18847 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF3P18847 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF3P18847 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF3P18847 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF3P18847 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF3P18847 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF3P18847 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATF3P18847 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF3P18847 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF3P18847 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF3P18847 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF3P18847 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF3P18847 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF3P18847 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF3P18847 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF3P18847 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF3P18847 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF3P18847 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF3P18847 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF3P18847 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF3P18847 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF3P18847 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF3P18847 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF3P18847 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF3P18847 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF3P18847 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATF3P18847 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATF3P18847 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATF3P18847 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATF3P18847 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATF3P18847 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATF3P18847 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATF3P18847 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF3P18847 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF3P18847 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF3P18847 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF3P18847 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF3P18847 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF3P18847 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF3P18847 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF3P18847 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF3P18847 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF3P18847 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF3P18847 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF3P18847 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF3P18847 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF3P18847 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF3P18847 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF3P18847 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF3P18847 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATF3P18847 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms