Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ZNF3P17036 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms