Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CTLA4P16410 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms